Strateegiliseks eesmärgiks on edendada genoomika üldist teadmistebaasi, arendada vahendeid ja resursse, mis on vajalikud geenide ja geeniproduktide inimese tervisega seotud funktsioonide dešifreerimiseks, uurida nende omavahelisi interaktsioone ja suhteid keskkonnaga.

Põhilised uurimissuunad:

• Geeniekspressioon ja proteoomika (meetodid, geeniekspessiooni ja valkude profiilid) – tööprogrammis (WP) punkt 1.1.1

Eesmärgiks võimaldada teadlastel paremini dešifreerida geenide ja geeniproduktide funktsioone ning defineerida kompleksseid regulatsioonimehhanisme, mis kontrollivad põhilisi bioloogilisi protsesse.

Efektiivsete vahendite ja metoodikate väljatöötamine geeniekspressiooni ja valkude profiilide jälgimiseks ning valkude funktsioonide ja bioloogiliste molekulide interaktsioonide kindlaks tegemiseks elus rakus.

• Struktuuri genoomika (3-D struktuurid, valgu funktsioon, ravimite disainimine) – WP 1.1.2

Eesmärk: Võimaldada uurijatel efektiivsemalt ja suuremal määral kui see praegu on võimalik määrata valkude ja teiste makromolekulide 3-D struktuure, mis on oluline valkude funktsioonide väljaselgitamiseks ja oluline ravimite loomisel.

Efektiivsete meetodite väljatöötamine makromolekulide 3-D struktuuride kindlaks määramiseks

• Võrdlev genoomika ja populatsioonigeneetika (transgeensed- jt mudelorganismid, genotüpeerimise standard) – WP 1.1.3

Eesmärk: Võimaldada uurijatel kasutada mudelorganisme geenifunktsioonide prognoosimiseks ja testimiseks ning täielikult ära kasutada kogu Euroopa olemasolev teadmistebaas, et kindlaks määrata geenide funktsioonid ning nende seosed tervise või haigustega.

Uurimine keskendub mudelorganismide ja transgeensete vahendite väljatöötamisele ning genotüpiseerimise standardite loomisele.

• Bioinformaatika (meetodid, vahendid, andmete säilitamine, töötlemine, in silico analüüs) – WP 1.1.4

Eesmärk: Võimaldada uurijatele ligipääs efektiivsetele vahenditele, et uurida ja töödelda pidevalt kasvavaid genoomi andmete hulki ning teha see kättesaadavaks kogu teadlaskonnale lihtsal ja kergesti kasutataval kujul.

Uurimine keskendub bioinformaatika vahendite väljatöötamisele andmete säilitamiseks ja töötlemiseks; geeni funktsioonide in silico analüüsiks ning komplekssete regulatsioonivõrgustike simuleerimiseks.

• Multidistsiplinaarse funktsionaalse genoomika kasutamine peamiste bioloogiliste protsesside uurimisel (protsessid rakus, geenide identifitseerimine ja funktsiooni selgitamine) – WP 1.1.5

Põhiprotsessid rakkudes, nendes osalevate geenide identifitseerimine ning nende bioloogiliste funktsioonide dešifreerimine. 

Strateegiline eesmärk: Muuta Euroopa biotehnoloogiatööstus konkurentsivõimelisemaks.

Peamised uurimissuunad:

Eesmärk: Tehnoloogilised platformid uute diagnostika, haiguste ennetamise ning teraapiavahendite väljatöötamiseks. Haiguste ennetamise ja ravi kontekstis on eesmärgiks edendada akadeemilise ja tööstusliku poole koostööd läbi tehnoloogiliste platformide, kus multidistsiplinaarne lähenemine kasutades kaasaegset tehnoloogiat, mis on väljatöötatud genoomikas, võib palju kaasa aidata tervishoiu arengule ning vähendada kulutusi sellele läbi varase ja täpsema diagnoosivõimaluse, individuaalse raviplaani, läbi efektiivsemate metoodikate uute ravimite ning teraapiate väljatöötamisel jne.

Uurimissuunad:

• Ohutumad, efektiivsemad ravimid (mõistlik ja kiirendatud uute ravimite väljatöötamine) – WP 1.2.1
• Uued diagnostikavõimalused (väljatöötamine ja rakendamine) – WP 1.2.2

Varane diagnostika, haiguse kulu jälgimine, in vivo andmete analüüs

• Uued in vitro testid asendamaks loomkatseid (välja töötamine ja rakendamine) – WP 1.2.3
• Uute ennetavate ja ravi meetodite väljatöötamine ja testimine (somaatiliste rakkude teraapia sh tüvirakud näiteks neuroloogiliste ja neuromuskulaarsete häirete korral, geeniteraapia, immuunoteraapiad; innovatiivsed uuringud pot-genoomikas) – WP 1.2.4
• Rakenduslik postgenoomika (innovatiivsed uuringud, rakendamine) – WP 1.2.5

Erinevate uurimissuundade integratsioon geneetikas, fundamentaal- ja kliinilistes uuringutes, et oleks võimalik kasutada standardiseeritud uurimismaterjale – tüvirakkude pangad, kliiniliste uuringute protokollid, uued haigusi ennetavad ja ravimeetodid.

Et tagada sotsiaalselt vastutustundlike valikute tegemine, ühiskonna heakskiit ja efektiivsus uute tehnoloogiate arendamisel, on oluline tagada seadusandjate, eetikaekspertide, patsientide ühenduste ja muu ühiskonna aktiivne ja võimalikult varajane kaasamine dialoogi.

Strateegiline eesmärk: välja töötada täiustatud strateegiad haiguste ennetamiseks ja haigustega toime tulekuks, tervislikuks eluks ja vananemiseks. Uurimused on täielikult konsentreeritud genoomika integreerimisele läbi kõigi sobivate organismide , et jõuda sobivamate meetoditeni haiguste ja tervist mõjutavate tegurite uurimisel. Rõhk saab olema akadeemisliste uuringute läbi kogutud teadmistebaasi viimisel kliiniliste rakendusteni.

Uurimissuunad:

• Südame-veresoonkonna haigused, diabeet, haruldased haigused – WP 2.1.1

Eesmärk - Parandada haiguste ja suremuse oluliste põhjuste ennetamist ja ravi Euroopas. Euroopa teadusressursi koondamine võitluseks haruldaste haigustega.

Uurimused on fokusseeritud kliinilise ekspertiisi ja ressursside integreerimisele teemakohaste mudelsüsteemide ja arenenud vahenditega funktsionaalses genoomikas, et saavutada läbimurre haruldaste haiguste ennetamises ja ravis. 

• Võitlus antibiootikumide ja teiste ravimite suhtes tekkiva resistentsuse vastu – WP 2.1.2

Eesmärgiks on vastu astuda ravimite suhtes resistentsust tekitavate patogeenide tekkele, mis on suureks ohuks kogu tervishoiule.

Uurimused on fokusseeritud mikroobide genoomide ja/või peremees-patogeen suhe uurimisele, et välja töötada vaktsiine ja alternatiivseid strateegiaid. Samuti välja töötada strateegiad antibiootikumide optimaalseks kasutamiseks ravis. Anda tuge Euroopa epidemioloogilise järelvalve ja edasiantavate haiguste kontrolli võrgustikule.

• Aju uuringud ja närvisüsteemi haigused. – WP 2.1.3

Eesmärgiks on kasutada genoomi informatsiooni, et paremini mõista aju funktsioneerimist ja selle häireid ning vaimseid protsesse, et võidelda neuroloogiliste haiguste ja kõrvalekalletega.

Aju funktsioneerimise, kahjustuste, plastika ja taastumise, õppimise, mälu ja tunnetuse molekulaarsete ja rakuliste mehhanismide tundmaõppimine neuroloogiliste häirete ja haigustega võitlemiseks. Arendada uusi strateegiaid neuroloogiliste ja vaimuhaiguste ning häirete ennetamiseks ja raviks (nagu Alzheimeri, Parkinsoni, Creutzfeldt-Jakobsi tõbi), kaasaarvatud ravimisõltuvusega seonduvad haigused.

• Inimese arenemise ja vananemise protsesside uurimine – WP 2.1.4

Eesmärgiks on paremini mõista inimese arengut, rõhuga vananemisprotsessile. Inimese genoomi järjestus, genoomika ja post-genoomika uuringud, mis on suunatud inimese arengu ja tervisliku vananemise paremale mõitmisele, luua baas tõendusmaterjalidest, et parandada strateegiaid ja propageerida tervislikke eluviise ning tervislikku vananemist.

Uurimine keskendub järgmistele punktidele: inimese areng viljastumisest täiskasvanuni, vananemise molekulaarsed ja rakulised determinandid, seosed keskkonna, käitumise ja sooga. 

Strateegiliseks eesmärgiks on võitlus vähi vastu arendades paremaid patsientidele suunatud strateegiaid alates ennetamisest kuni efektiivsema ja võimalikult varase diagnoosimise ning parema ravini, millel oleks võimalikult vähe kõrvalmõjusid. Uurimine keskendub teadmiste ülekandmisele genoomikast ja teistelt uurimisaladelt rakendustele, mis parandaks kliinilist praktikat ja tervist üldiselt.

Patsiendile orienteeritud lähenemine sisaldab nelja omavahel seotud komponenti, millele uurimused on suunatud:

• rajatiste ja initsiatiivide loomine Euroopa vähiuuringuteks; tõendusmaterjalil põhineva hea kliinilise praktika juhendite loomine; tervishoiu strateegia välja töötamine, mis võtaks arvesse kaasaegseid uurimistulemusi ja toetaks nende jõudmist praktiliste tulemuste ja rakendusteni.
• Kliinilise uurimistöö toetamine, eriti kliinilised testid, mis on suunatud uute ja paremate ravivõimaluste katsetamisele. Funktsionaalse onkogenoomika uuringutulemiste ja teadmiste ülekandmine vähidiagnostikasse ning ravisse
• Teadusuuringute toetamine baasteadmiste toomisega läbi rakenduste kliinilisse praktikasse ja rahvatervishoidu
• Teised vähiga seotud küsimused nagu vananemine ja vähk, regionaalsed erinevused, psühho-sotsiaalsed aspektid, haiguse kulgu kergendav hoolitsus, juhised tugigruppidele

• HIV/AIDS, malaaria, tuberkuloos (uued vaktsiinid, teraapiad, mikrobiotsiidid) – WP 2.3.0

Strateegiliseks eesmärgiks on vastu astuda globaalsetele probleemidele, mis on põhjustatud kolme edasiantava haiguse poolt – HIV/AIDS, malaaria, tuberkuloos – arendades efektiivseid haiguse levikut pidurdavaid vahendeid, eriti kasutamiseks arengumaades. Arengumaad peaksid olema selle teema täitmisel olulisteks parneriteks osaledes otseselt erinevates tegevustes ja kliiniliste testide programmides.

Uurimused keskenduvad järgmisele: kõnealuste haiguste levikut pidurdavate uute vaktsiinide, teraapiate, mikrobiotsiidide loomine läbi toetuste uuringutele kogu spektris. Nende haiguste ravi kliinilised katsetused – ravi kliiniliste katsetuste programmi loomine Euroopas suunaga abistada arengumaid. AIDSi ravi kliiniliste testimiste võrgustiku loomine Euroopas.

Meelis Kadaja
SA Archimedes
Väike-Turu 8
51013 Tartu
Telefon: 7300 332
Faks: 07 300 336
E-post: meelis@archimedes.ee