6RP esimese prioriteedi kolmas projektikonkurss kuulutati välja 15. juunil 2004. Projektikonkurss on jagatud kaheks: põhikonkursiks tähtajaga 16. november 2004 ning eraldi konkursiks ühele vähiuuringute koordineerimisega seotud teemale tähtajaga 9. september 2004. Käesoleval projektikonkursil peegeldab enamus teemasid Advisory grupilt, programmikomiteelt, ideede konkursilt (expression of interest) ning ka erinevatelt konverentsidelt ja workshopidelt kõlanud mõtteid.
Kuna esimesel ja teisel projektikonkursil oli finantseeringu saanud projektides väikese ning keskmise suurusega ettevõtete (SME) osakaal vaid 9% (nõutud 15% asemel), siis rõhutatakse veelgi rohkem SME-de kaasamise olulisust. Käesoleval projektikonkursil on lisatud spetsiaalsed teemad, kus oodatakse SME-de osalust rohkem kui 15% ulatuses. Tuleval aastal väljakuulutataval neljandal projektikonkursil on oodata veelgi täiendavaid samme SME-de aktiivsuse tõstmiseks 6RP esimeses prioriteetses valdkonnas osalemiseks.
Nii nagu teises projektikonkursis, tuleb uurimistöödes erilist tähelepanu pöörata lastehaigustele ning soolistele erinevustele. Palutakse pöörata suurt tähelepanu eetilistele arusaamadele eriti uurimistöödel inimestega (kliinilised katsetused), tüvirakkudega, inimpäritolu bioloogiliste ainetega ning loomkatsetusel. Alateema Vaesusest tingitud haiguste leviku pidurdamine puhul soovitatakse rõhku panna arengumaade organisatsioonide kaasamisele.
Kolmanda projektikonkursi eelarveks on 544 miljonit eurot. Eelarve jagunemine erinevate alateemade vahel on näidatud tabelis 1. Samuti võib tabelist näha käesoleva konkursi eelarve võrdlust teiste esimeses prioriteedis olnud või tulevate projektikonkurssidega.
Tabel 1. Eelarve jagunemine erinevate projektikonkursside vahel
|
Esimene kutse |
Teine kutse |
Kolmas kutse |
Neljas kutse |
Kokku |
||||
|
Valdkond\ tähtaeg |
märts 2003 |
nov. 2003 |
Apr. 2004 |
märts 2004 |
Sept. 2004 |
nov. 2004 |
Nov. 2005 |
|
|
M € |
M € |
M € |
M € |
M € |
M € |
M € |
M € |
|
|
1.1 |
166 |
167 |
- |
- |
- |
120 |
112 |
565 |
|
1.2 |
135 |
165 |
- |
- |
- |
131 |
135 |
566 |
|
2.1 |
122 |
121 |
- |
- |
- |
132 |
145 |
520 |
|
2.2 |
137 |
- |
- |
- |
- |
95 |
74 |
306 |
|
2.3 |
73 |
- |
- |
12 |
- |
54 |
67 |
206 |
|
3 |
5 |
4 |
4 |
- |
- |
8 |
6 |
27 |
|
Kokku |
638 |
457 |
4 |
12 |
- |
540 |
539 |
2190 |
|
Artikkel 169 |
200 |
4 |
204 |
|||||
Ülevaade kolmandal projektikonkursil avatud teemadest
Siinkohal antakse ülevaade 6RP LifeSciHealth valdkonna kolmandal projektikonkursil olevatest teemadest, mis avaldati 15. juuni tööprogrammis. Tööprogrammi (Work Programme) võib leida Euroopa Liidu Innovatsioonikeskuse koduleheküljelt (www.irc.ee) või Cordise LifeSciHealth valdkonna kodulehelt (www.cordis.lu/lifescihealth/home.html).
1. Fundamentaaluuringud organismide funktsionaalse genoomika arendamiseks
Üldiseks eesmärgiks on suurendada genoomikaalaseid teadmisi alusuuringute ja selleks vajalike töövahendite arendamisega. Uuringute peamiseks sihtmärgiks on inimese tervisega seotud geenid ja geeniproduktid, nende funktsioonid ning interaktsioonid ümbritsevaga.
1.1.1 Geeniekspressioon ning proteoomika.
- Valkude ruumilise ja ajalise rakusisese organisatsiooni analüüsimiseks vajalike tehnoloogiate arendamine. Antud teema hõlmab ka meetodeid süstemaatiliseks andmete kogumiseks tervet rakku hõlmava kvantitatiivse geeniekspressiooni kohta- IP (Integrated Projects)
- Suure väljalaskevõimega tehnoloogiate arendamine histoonide modifikatsioonide ja teiste kromatiini ning tuuma struktuuridega seotud regulatsioonisüsteemide uurimiseks- IP (Integrated Projects)
1.1.2 Struktuurne proteoomika
- Suure läbilaskevõimega tehnoloogiate arendamine makromolekulide struktuuride kindlaks tegemiseks- IP (Integrated Projects)
1.1.3 Võrdlev ning populatsioonigeneetika
- Suure läbilaskevõimega tehnoloogiate ning meetodite väljaarendamine ja kasutamine suuremahuliseks andmete kogumiseks haigustega seotud geenifunktsioonide kohta (põhineb roti mudelil)- IP (Integrated Projects)
- Mutagenees üle terve hiire genoomi. Projekti eesmärgiks on muteerida kõik 23 000 hiire geeni. Tulemuseks on vabalt kättesaadav hiire embrüonaalsete tüvirakkude pank- IP (Integrated Projects)
1.1.4 Bioinformaatika
- Üle-Euroopaline andmebaaside ja tarkvarade loomine ning ühendamine funktsionaalsest genoomikast tulenevate komplekssete uurimistulemuste tõlgendamiseks- NoE (Network of Excellence)
1.1.5 Multidistsiplinaarse funktsionaalse genoomika rakendamine peamiste bioloogiliste protsesside uurimiseks
- valkude posttranslatsioonilises modifitseerimises osalevate geenide ning geeniproduktide funktsioonide väljaselgitamine (nt ubikvitiin-proteosoomrajad ning glükosüleerimis-deglükosüleerimisrajad)- IP või NoE
- rakusiseste transpordimehhanismide rakendamine polüpeptiidsete kasvufaktorite signaaliradades- IP
- funktsionaalse genoomika kasutamine alternatiivse splaissingu uurimiseks, et selgitada välja alternatiivsest splaissingust tulenevate produktide funktsionaalsed erinevused ning iseloomustada koe- ja diferentseerumisspetsiifilise splaissingu regulatoorsed komponendid - NoE
- Ööpäevarütmide molekulaarsete kontrollmehhanismide uurimine erinevates mudelorganismides- NoE või IP
- Inimeste embrüonaalsete tüvirakkude diferentsieerumist tagavate bioloogiliste protsesside väljaselgitamine. Tähelepanu tuleb pöörata siinkohal ka tulemuste levitamisele teadlaskonnas- IP
SME-de kaasmine on väga soovitatav kõigis teemades. Teema, mis on juba kajastatud IP-na või NoE-na ei ole enam kõlblik STREP-na esitamiseks.
Koordineerimistegevustena (CA) esitatavad teemad
Eritoetustegevustena (SSA) esitatavad teemad
Strateegiliseks eesmärgiks on muuta Euroopa biotehnoloogiatööstus konkurentsivõimelisemaks. Peamiselt püütakse seda saavutada, toetades selliste teadusasutuste ja ettevõtete koostööd, mis võiks viia uute ravimeetodite ja diagnostikavõimaluste väljatöötamisele.
1.2.1 Uute, ohutumate ning efektiivsemate ravimite kiirem ja ratsionaalsem arendamine
- uudsed lähenemised uute, ohutumate ning efektiivsemate ravimite arendamiseks. Antud teema puhul tuleb välja pakkuda uus laiahaardeline lähenemine ravimiarenduses, kasutades viimaseid teaduslikke saavutusi. Seejuures tuleb leida käesolevate ravimiarenduse strateegiate kitsaskohad ning välja pakkuda lahendusi.- IP
- farmakogenoomika personaalmeditsiinis, mille peamiseks eesmärgiks on muuta uued ravimid spetsiifilisemaks. Uurimistöö peaks keskenduma ravimi interaktsioonidele vastavate retseptoritega, transpordi- ning metabolismimehhanismidega.- IP
- Tüvirakkude ning primaarsete rakkude potentsiaal haruldaste monogeensete haiguste uurimisel ja uute ravimite väljaarendmine. Eelkõige soovitatakse kasutada muteeritud tüvirakke ning primaarseid rakukultuure, et mõista monogeensete haiguste molekulaarseid ja rakulisi mehhanisme- IP
- standardiseeritud meetodid bioravimite immunogeensuse tuvastamiseks- STREP
- uuringud "mikrodoosidest", et saavutada ravimite paremaid omadusi.- STREP (SME)
- Valgupõhise ravimi sihtmärgile toimetamine- STREP (SME)
- Workshopid ning kursused teemal: bioloogilised vastused bioravimitele- SSA
1.2.2 Uute diagnostikameetodite arendamine
- Uued strateegiad tahkete vähkkasvajate varajases diagnostikas. Uuringud peaksid olema eranditult suunatud tuumorite molekulaarsele kirjeldamisele ning metabolismi jälgimisele, et välja arendada uusi ning täiustatud vahendeid kasvajate ennetamiseks ning diagnoosimiseks. Kasutada tuleb seejuures uusimaid genoomika, proteoomika, nanotehnoloogia ning biotehnoloogia lähenemisi.- IP
- Testid hematoloogiliste ebanormaalsuste tuvastamiseks ja jälgimiseks- STREP (SME)
- Alkoholist põhjustatud maksahaigustega seotud molekulaarsete ja geneetiliste markerite tuvastamine.- STREP (SME)
- Uued diagnostikavahendid inimeste ning loomsete prioonitega seotud haiguste tuvastamiseks.- STREP (SME)
- Workshop vereproduktide kvaliteedikontrollist, mida kasutatakse vereülekannetel ning organite transplantatsioonil.- SSA
- Workshop eetilistest aspektidest, mis on esile kerkinud uute diagnoosimismeetoditega.- SSA
- Workshop uute diagnoosimeetodite perspektiividest ning suundadest.- SSA
1.2.3 Uute in vitro testide väljatöötamine, et asendada loomkatseid
- Rakupõhised süsteemid erinevate ainete toksilisuse hindamiseks. Siinkohal on väga oluline jälgida panust "kolme R-i" (loomkatsete vähendamine (reduction), asendamine (replacement) ja rafineerimine(refinement)) - IP
- In vitro mudelsüsteemide optimeerimine, et uurida maksas ning soolestiku epiteelis toimuvat ainete imendumist, modifitseerimist ja kahjutuks muutmist.- STREP (SME)
- Workshop keemiliste ainete riskianalüüsi optimeerimisest loomkatsetest, mitteloomakatsetest ning arvutitel modelleerimisest saadud andmete integreeritud kasutamisega.- SSA
- Analüüs minisigade kasutamisest mudelsüsteemidena uute ravimite ja kemikaalide toksilisuse testimesel.- SSA
1.2.4 Uute ennetavate meetmete ja ravimeetodite nagu somaatiliste geenide teraapia, raku- ning immuunoteraapiate testimine
Siinkohal on silmas peetud eriti tüvirakkudel põhinevate teraapiate kasutamist neuroloogiliste ning hematopoeetiliste haiguste ravimiseks.
- Piirangute ületamine tüvirakkude kasutamisel tahkete kasvajate ravil. Antud projekt peab keskenduma allogeensete hematopoeetiliste tüvirakkude transplantantsiooni tehnoloogiate arendamisele. Eesmärgiks on paremini mõista siire versus kasvaja (graft vs tumour) efekti immunoloogilisi mehhanisme ning seeläbi püüda suurendada kasvajavastast spetsiifilisust ning vähendada siire versus peremees (graft vs. host) efekti. - IP
- Kemokiinide kasutamine krooniliste põletike ning autoimmuunhaiguste ravimiseks. Antud projektis tuleb ära kasutada teadmisi, et kemokiinid on võimelised kontrollima immuunsüsteemirakkude aktiivsust ja liikumist. Projekti eesmärgiks on paremini mõista kemokiinide retseptoreid ja retseptor-väikemolekulide interaktsioonide modelleerimisega töötada välja madalmolekulaarseid antagoniste. - IP
- Kliiniliste geeniülekannete kvaliteedi ning ohutuse standartid. - NoE
- Uute mitteviiruseliste geeniülekandetehnoloogiate arendamine ex vivo geenipõhistes teraapiates.- STREP (SME)
- Tüvirakude kasutamine seljaajuvigastuste parandamiseks.- STREP
- Nabaväädi veretüvirakkude ravipotentsiaali uurimine (v.a. allogeenne hematopoeetiline transplantatsioon).- STREP
- Onkolüütiliste viirusvektorite loomine vähiraviks. Projekti käigus tuleb hinnata ka loodud ravivahendi ohutust ning patogeensust tervetele kudedele.- STREP (SME)
- Workshop siRNA meetodi kasutamisest embrüonaalsete tüvirakkude kasvu ja diferentseerumise uurimisel ning tüvirakkude kasutamisest geeniteraapia vahendina.- SSA
1.2.5 Rakenduslik postgenoomika
- Postgenoomika arusaamaks astma molekulaarsetest mehhanismidest. Projekt peab keskenduma eelkõige astmat põhjustavate geneetiliste ja keskkonnategurite omavahelistele interaktsioonidele.- IP (SME)
- Postgenoomika põletikuliste reumaatiliste haiguste uurimiseks, mis viiks paremale ravile. Eelkõige oodatakse siinkohal analüüsimeetodite väljatöötamist, mis aitaks raviviisi üle otsustamisel.- IP (SME)
- Postgenoomika inimese pandeemse gripiviirusevastase vaktsiini arendamiseks. Projekti eesmärgiks peab olema vaktsiini disainisüsteemi loomine, millega oleks võimalik kiirelt välja arendada vaktsiin võimaliku pandeemia korral- IP (SME)
- postgenoomika komplekssete multifaktoriliste haiguste uurimiseks (v.a. vähk). Eduka projekti tulemuseks peaks olema haigust põhjustavate geenide kaardistamine, riskifaktorite tuvastamine ning nende vaheliste interaktsioonide välja selgitamine, mille tulemuseks on parema diagnostika ja ennetamine.- STREP (SME)
2.1 Rakendusliku genoomika kasutamine arstiteaduses ja meditsiinilistes tehnoloogiates (SME-de osalemine on väga soovitatav kõikides selle valdkonna teemades).
- workshop koostöö võimalikkusest kolmandate riikidega Ladina-Ameerikas, India poolsaarel ning Kagu-Aasias.- SSA
2.1.1 Võitlus südame- ja veresoonkonnahaiguste, diabeedi ning haruldaste haiguste vastu
- Südamelihasrakkude genoomika, keskendudes südameriketega seotud signaaliradadele.- IP
- Südame areng ning reparatsioonisüsteemid. Uurimistöö peab viima paremale arusaamisele südamehaiguste patofüsioloogiast ning arendama edasi rakulist asendusteraapiat. Siinkohal pole lubatud uurida luuüdi rakkude diferentseerumist südamespetsiifilisteks rakkudeks- IP
- Funktsionaalne genoomika vaskulaarse remodelleerimise molekulaarsete aluste uurimiseks, arvestades sealjuures interaktsioone erinevate rakutüüpide vahel. Projekt võib olla suunatud ateroskleroosi uurimiseks- IP
- Arütmiaga seotud ioonkanalite genoomika- STREP
- Funktsionaalne genoomika ning molekulaarsed markerid esimest tüüpi diabeedi ennetamiseks. Projekt peab selgitama erinevate geneetiliste tegurite (nt. immunogeneetilised determinandid nagu HLA haplotüübid) rolli esimest tüüpi diabeedi väljaarenemisel, et hõlbustada paremate profülaktiliste strateegiate väljatöötamist- IP
- kõhunäärme b-rakkude ja teiste sellega seotud kudede funktsionaalne genoomika teist tüüpi diabeedi ravimiseks ja ennetamiseks. Projekt peab selgeks tegema patofüsioloogilised võtmemehhanismid, mis vastutavad insuliini sekretsiooni väärtalitluse eest teist tüüpi diabeedi korral- IP
- rasvkoe ning maksa väärtalitlus metaboolses sündroomis. Projekt peab selgitama lipiidide ebaõige metabolismi, insuliini signaaliradade ning glükoosi taseme regulatsioonivahelisi suhteid- IP
- diabeedist põhjustatud komplikatsioonide patofüsioloogiliste aluste genoomika- STREP
- rakutuuma ebaõigest ülesehitusest (nt. tuumamembraanivalkude defektid) põhjustatud haruldased haigused- STREP
- farmakogenoomika, mis on seotud teatud kindlate ravimmärklaudadega- STREP
- tsüstilise fibroosiga seotud tegevuste koordineerimine Euroopas- CA
- metodoloogilised väljakutsed haruldaste haiguste varajastes kliinilistes katsetustes.- CA/SSA
2.1.2 võitlus resistentsuse vastu antibiootikumidele ja teistele ravimitele
- Alumiste hingamisteedega seotud nakkushaigustega toimetulek. Eesmärgiks peab olema mikrobioloogia ja genoomika ühendamine kliiniliste uuringutega, et tulla paremini toime alumiste hingamisteedega seotud haigustega, sealhulgas sihiga vähendada resistentsust antibiootikumidele.- NoE
- Liikuvate geneetiliste elementide roll antimikroobse resistentsuse tekkimisel.- STREP
- Ökoloogilised faktorid, mis mõjutavad resistentsete bakteriaalsete patogeenide kohasust ning virulentsust.- STREP
- fungitsiidide vastase resistentsuse kontroll.- STREP
- workshop antimikroobse resistentsuse uurimistulemuste viimisest kliiniliste rakendusteni- SSA
- workshop tsentraalselt toetatud mikroobigenoomide annotatsioonisüsteemi loomisest- SSA
2.1.3 Ajuuuringud ning närvisüsteemihaigused
- sünaptilise informatsiooni protsessingu molekulaarsed mehhanismid. Projekti eesmärgiks peaks olema signaali ülekandemehhanismidest arusaamine alates neurotransmitteritest ning geenide regulatsioonitasemest kuni sünaptilise protsessingu ja plastilisuseni.- IP
- Neuroimmuunhaigused: alusuuringutest kliiniliste katsetusteni (nt multiple sclerosis). Projekti käigus tuleb identifitseerida neid haigusi põhjustavad geneetilised faktorid ja keskkonnategurid, mis viiks uute biomarkerite tuvastamiseni varajasemaks diagnostikaks ning uudseteks ravisrateegiateks- IP
- Düsleksia e. vaeglugemise neurobioloogia. Sellel projektil peab olema silmnähtav panus varajasele diagnoosimisele ning haiguse ravimisele lastel- STREP/CA
- une ning unehäirete neurobioloogia ja geneetika.- STREP (SME)
- Neuroteaduse tugevdamine Euroopas. Projekti tulemuseks peab olema silmapaistvate neuroteadusega tegelevate keskuste vahelise võrgu loomine ja tugevdamine- SSA/CA
- workshop neuroimaging-meetodi vajalikkusest aju-uuringutes- SSA
-
workshop aju-uuringutest saadud andmete kogumisest ühtsesse andmebaasi- SSA- konsensusdokument aju-uuringute tulevikust Euroopas
2.1.4 Inimese arengu- ning vananemisprotsesside uuringud
- vananemise proteoomika. Projekti eesmärgiks on uurida välja inimese ning mudelorganismide vananemisega seotud valgutasemete muutused, valk-valk interaktsioonid ja valkude posttranslatsioonilised modifikatsioonid. Antud projekti käigus tuleb uurida vananemist kui sellist, mitte aga vananemisega seotud haigusi.- IP
- Rakutuumaretseptorite roll inimese arengus ning vananemises- IP
- Elastsete kudede (nt. naha, veresoonte) vananemine. Eriline tähtsus on vananemisest tulenevate koe struktuurimuutuste ning koe funktsiooni vaheliste seoste arusaamisel. – STREP (SME)
- Üleminekuea hormoonasendusravi riskianalüüs- STREP
- konverents vananemisuuringute hetkeseisust ning tuleviku väljavaadetest Euroopas.- SSA
2.2 Võitlus vähi vastu
Võitluses vähi vastu on üldisemaks eesmärgiks luua paremad patsientidele orienteeritud strateegiad ennetusest ja efektiivsemast ning varasemast diagnostikast, kuni minimaalsete kõrvalefektidega raviviisideni. SME-de osalemine on eriti oodatud kõikidel selle valdkonna teemadel.
- Üle-Euroopalise võrgustiku loomine haruldaste vähkkasvajate uuringute edendamiseks- NoE
- Asjakohaste loomsete mudelite loomine prekliinilisteks testideks ning uute ravimeetodite hindamiseks.- IP
- Infektsiooniliste agentidega seotud vähkkasvajate uuringud. Lisaks teadmiste suurendamisele bioloogilistest ja molekulaarsetest mehhanismidest, tuleb tähelepanu pöörata ka ravistrateegiate uurimisele, eriti viiruseliste või bakteriaalsete geenide vastu suunatud strateegiatele.- IP
- Vähi ennetamine riskigruppides. Projekti eesmärgiks peab olema vähi arengus oluliste geenikeskkonnavaheliste vastasmõjude tuvastamine ja seeläbi riskigruppides profülaktiliste strateegiate identifitseerimine - NoE
- Immuunsüsteemi kasutamine vähi kontrollimiseks.- IP
- Pärilike vähkkasvajate tuvastamine, ennetamine ja ravi (nt. eesnäärme-, munasarja-, rinna-, soole-, nahavähk). Projekti eesmärgiks on iseloomustada vastuvõtlikud geenid, tuvastada nende molekulaarne "tunnusmärgid" ja arendada välja mudelid varajaseks diagnoosimiseks ning profülaktikaks kahe või rohkema vähi jaoks- STREP
- Vähirakkude väga varajane molekulaarne diagnostika ja ravi. Projekt peab keskenduma molekulaarsetest mehhanismidest ja "tunnusmärkidest" arusaamisele, mis annavad märku vähirakkude olemasolule juba vähi arengu väga varajastes staadiumites. - STREP (SME)
- Vähkkasvaja-peremeesorganismi vahelised interaktsioonid. Kombineeritud jõupingutused tuleb suunata loomsete mudelite loomisele ja rakendamisele, mis oleksid adekvaatsed raskelt ravitavatele inimese vähitüüpidele- STREP
2.3 Vaesusest tingitud haiguste leviku pidurdamine
Strateegiliseks eesmärgiks on vastu astuda globaalsele ohule, mis on põhjustatud kolme peamise nakkava haiguse poolt: HIV/AIDS, malaaria ja tuberkuloos.
2.3.1 Potentsiaalse vaktsiini ning ravimeetodite arendamine
- Uued lähenemised HIV/AIDS-i vaktsiinide arendamiseks- IP/NoE
- Uute ravimite ning ravimikombinatsioonide väljatöötamine malaaria raviks- IP
- Malaariavastased vaktsiinid- IP/NoE
- Uute ravimite arendamine tuberkuloosi raviks- IP
- Neonataalne (vastsündinute) immuunsus. Projekt peab uurima vastsündinute immuunsusmehhanisme ning leidma meetodeid noorte laste immuunvastuse stimuleerimiseks- STREP
- Üheaegsete infektsioonide immunoloogilised tagajärjed. Toetus antakse immuuno-epidemioloogilisteks uuringuteks HIV-i, malaaria ja/või tuberkuloosi üheaegsete nakkuste uurimiseks. Paralleelselt tuleb analüüsida ühe ja mitme nakkusega kliiniliste proovide immunoloogilisi erinevusi- STREP
- Vaesusest tingitud haiguste SME-de poolt teostatavad uuringud. SME-sid julgustatakse siinkohal algatama või osalema HIVi-, malaaria- ning tuberkuloosiuuringutes eesmärgiga tuvastada uusi ravimeid või vaktsiinikandidaate- STREP (SME)
- HIV/AIDSi kliiniliste uuringute koordineerimine Euroopa ja rahvusvahelisel tasemel- CA
- Biotehnoloogiatööstuse, bioinkubaatorite ja biotehnoloogiainvestorite vaheliste tegevuste koordineerimine vaesusest tingitud haiguste uurimisel- CA
Meelis Kadaja
SA Archimedes
Väike-Turu 8
51013
Tartu
Telefon: 730 0332
Faks: 730 0336
E-post: meelis@irc.ee